M-3 특공대 시즌 2

우주공간 한가운데 M-3 삼총사가 정신을 잃은 채 떠다니고 있다. 잠시 후 아머가 눈을 뜨고 마이너와 에어포서도 정신을 차린다. 곧, 그들 앞에 거대한 물체가 다가옴을 느끼는데..

다크마욜은 자신이 다크콘탁의 아들이라는 걸 밝히지만 멍청한 레비져들은 그것이 무슨 말인지 알아듣지 못한다. 한편 아머는 교사 뒤로 무언가 떨어지는 것을 본 뒤 그게 무엇인가 살펴보려 교사 뒤편으로 갔다가 위험에 처하고 만다.

다크마욜은 취조관을 감염시켜 자신의 수하로 만든다. 그리고 전학생인 것처럼 위장해 교실로 간 다크마욜은 상호 옆자리에 앉게 된다. 상호는 다크마욜에게서 다크콘탁의 얼굴을 보고, 무언가 심상치 않은 기운을 느낀다. 한편 아머는 네오다크 커밋 안에 고꾸라져 있는데 그 속에서 머드맨이라는 괴상한 몬스터와 맞닥뜨리게 된다.

고박사에 의해 위기를 맞은 아머는 결국 정신을 잃고 말고, 머드맨은 아머가 똑같은 모습으로 변신해 지구방위대로 가기에 이른다. 한편 학교에서 취조관은 계속해서 횡설수설 이상한 소리를 늘어놓고 있는데...

아머의 모습으로 변신한 머드맨은 지구방위대 내부에 잠입해 사령관을 납치해 가려고 하다가 하박사와 맞닥뜨린다. 외양만 보고 그가 아머인 줄 알고 있는 하박사 역시 머드맨에 의해 위기를 맞게 된다.

라므토의 숲에서는 지구를 구하기 위해 이백여년 전 과거에서 미래로 왔다는 소년과 거인 하나가 나와 다산과 윙보 앞에 모습을 드러낸다. 다산은 그들의 말에 코웃음을 치다가 갑자기 숲에서 수십명의 변발족들이 나와 소년과 거인을 공격하자 깜짝 놀란다.

사령관은 머드아머에게 납치당하고...라므토의 숲에서는 루이와 게르샤에게 지하세계 이야기를 듣게 된다. 한편 사령부에서는 마리너와 에어포서가 깨어난다.

깨어난 마리너와 에어포서는 전보다 작아진 자신들을 궁금해하고 하박사는 라므토에 의해 일어난 증상으로 추측한다.

다크콘탁 일당은 사령관으로부터 자백을 받아내려 하지만 쉽지 않다. 고박사는 신무기 레비져 튠건을 완성해 다크마욜에게 전해주며 다크콘탁의 부활을 위해 필요한 세가지를 알려준다.

다크마욜은 레비져들에게 새로운 임무를 지시한다. 자매니르는 다크콘탁의 움직임이 심상치 않다는 것을 예감하는데..

지하세계로 떨어진 상호와 에어포져와 마리너는 잡혀간 아머와 사령관을 발견하고, 구하려 하지만 거대한 머드맨이 그들의 앞을 지키고 있는데..

상호와 에어포져와 마리너는 아머와 사령관을 구출하는데 온 힘을 쏟지만 머드맨의 파워는 만만치 않다. 사령관을 감시하는 거대 넝쿨까지 그들을 공격하면서 위기에 빠지게 되는데..

M-3 특공대와 상호에게서 지하세계에 대한 보고를 받은 하박사는 지하세계와 라므토의 관계에 대해 의심한다. 한편, 아무도 모르게 다산이 사라지고 루이는 쉐도우 머더를 의심한다.

드디어 몸을 얻게 된 다크콘탁은 본격적인 지구 공략을 시도한다. 사령관은 상호에게 라므토의 숲에 대해 물어보면서 함께 가보자는 제의를 한다.

고박사는 배트퀸을 과거의 일을 회상하고 잠시 추억에 젖는다. 없어진 다산을 찾아 크리스탈궁으로 간 루이는 놀라운 광경을 발견하게 되는데..

레비져로 변한 사령관과 일대 결전이 벌어지고, 상호일행은 어둠의 부활이 가까워졌을음 예감한다.

상호일행은 다크콘탁도 없애고 다크콘탁과 한 몸이 된 다산을 구할 방법을 의논하지만 다산을 물리쳐야 다크콘탁을 없앨수 있다는 자매니르의 말을 듣고 모두들 실망한다.

오랜만에 학교에 돌아온 상호와 태수는 아무도 없는 학교를 돌아보며 친구들을 찾는다. 옥상위에서 왕윤과 태수를 발견한 상호일행은 반가운 마음에 달려가지만...

새로운 몸으로 거듭난 다크콘탁은 다크마욜에게 맡겨둔 구슬을 내놓으라 하고, 구슬이 없어지면 자신의 힘이 없어진다는 것을 알고 있는 다크마욜은 반발하는데...

레비져들에게 막다른 곳까지 쫓기던 다크 마욜 앞에 정체 모를 한줄기 빛이 보인다. 배트퀸을 쫓던 상호와 M-3특공대는 예상치 못한 공격을 받고 당황한다.

라므토의 신호를 받고 급하게 숲으로 돌아온 하림은 나무에 묶여있는 자매니르와 하박사를 발견한다. 자신의 잘못을 뉘우친 다크마욜은 루이와 함께 모두를 구할 방법을 의논한다.

새로운 몸과 함께 라므토를 손에 넣은 다크콘탁은 마지막 한 가지를 얻기 위해 힘을 기울인다. 숲으로 출동 중이던 M-3 특공대는 몸의 이상을 느끼게 된다..

도치의 침을 맞고 쓰러진 배트퀸 에게 달려온 상호는 눈물을 흘리고. 의아해 하는 일행은 상호의 얘기를 듣고 놀라는데..

윙보와 하림은 라므토를 되찾기 위해 지하세계로 들어간다. 인간의 모습으로 되돌아온 배트퀸을 찾아온 고박사는 잠든 배트퀸을 다크콘탁의 기지로 몰래 데려가는데..

에어포서는 부상을 당한체 기지로 돌아오고 하림의 안전을 걱정한 하박사는 방위군의 출동을 명령한다.

고박사와 하박사는 서로의 손을 잡고 지난 일을 사과한다. M-3 특공대는 특별한 성장을 통해 더욱 강한 로봇으로 거듭난다.